進(jìn)入?20?世紀(jì)?90?年代，青藏高原研究被列入以下?3?大計(jì)劃：“八五”攀登計(jì)劃“青藏高原形成演化、環(huán)境變遷與生態(tài)系統(tǒng)研究”（1992—1996?年），“九五”攀登計(jì)劃“青藏高原形成演化及其環(huán)境資源效應(yīng)”（1997—2000年），國(guó)家重點(diǎn)基礎(chǔ)研究計(jì)劃“青藏高原形成演化及其環(huán)境、資源效應(yīng)”（1999—2003?年）。與?20?世紀(jì)?80?年代以前的研究工作相比，特別是針對(duì)過(guò)去區(qū)域、路線(xiàn)考察的薄弱環(huán)節(jié)，這些計(jì)劃面向國(guó)際研究的前沿領(lǐng)域，強(qiáng)調(diào)了從以定性研究為主轉(zhuǎn)向定量、定性相結(jié)合研究，從靜態(tài)研究轉(zhuǎn)向動(dòng)態(tài)、過(guò)程和機(jī)制研究，從單一學(xué)科研究轉(zhuǎn)向綜合集成研究，從區(qū)域研究轉(zhuǎn)向與全球環(huán)境變化相聯(lián)系的研究。

2003?年，在時(shí)任中共中央政治局常委、國(guó)務(wù)院副總理李嵐清的親切關(guān)懷下，成立了中科院青藏高原所，以專(zhuān)門(mén)致力于我國(guó)青藏高原的科學(xué)研究事業(yè)。2014?年，中科院青藏高原地球科學(xué)卓越創(chuàng)新中心成立。作為青藏高原研究的國(guó)家隊(duì)，青藏高原所和青藏高原地球科學(xué)卓越創(chuàng)新中心堅(jiān)持服務(wù)國(guó)民經(jīng)濟(jì)主戰(zhàn)場(chǎng)，高水平完成了《西藏高原環(huán)境變化科學(xué)評(píng)估》，習(xí)近平總書(shū)記在中央第六次西藏工作座談會(huì)上對(duì)該評(píng)估給予高度評(píng)價(jià)，并作為提出西藏生態(tài)文明建設(shè)指示的重要科學(xué)基礎(chǔ)。在中科院的支持下，啟動(dòng)了“第三極環(huán)境（TPE）”國(guó)際計(jì)劃，推動(dòng)我國(guó)青藏高原研究進(jìn)入國(guó)際第一方陣。

習(xí)近平總書(shū)記高度重視青藏高原的生態(tài)環(huán)境保護(hù)與發(fā)展，他指出要“守護(hù)好世界上最后一方凈土”。為貫徹落實(shí)習(xí)總書(shū)記關(guān)于青藏高原生態(tài)環(huán)境保護(hù)與發(fā)展的重要指示精神，2017?年?3?月，中科院和西藏自治區(qū)簽訂新一輪院區(qū)戰(zhàn)略合作協(xié)議，確定由青藏高原所牽頭，協(xié)調(diào)全國(guó)力量，聯(lián)合國(guó)際伙伴，共同開(kāi)展第二次青藏高原綜合科學(xué)考察研究。第二次青藏高原綜合科學(xué)考察研究將根據(jù)國(guó)家重大需求和國(guó)際科學(xué)前沿，揭示過(guò)去50年來(lái)環(huán)境變化的過(guò)程與機(jī)制及其對(duì)人類(lèi)社會(huì)的影響，預(yù)測(cè)這一地區(qū)地球系統(tǒng)行為的不確定性，評(píng)估資源環(huán)境承載力、災(zāi)害風(fēng)險(xiǎn)，提出亞洲水塔與生態(tài)屏障保護(hù)、第三極國(guó)家公園建設(shè)和綠色發(fā)展途徑的科學(xué)方案，為生態(tài)文明建設(shè)和“一帶一路”建設(shè)服務(wù)。

2017?年?8月19日，在第二次青藏高原綜合科學(xué)考察研究全面展開(kāi)之際，習(xí)近平總書(shū)記高度關(guān)懷，發(fā)來(lái)賀信，作出了重要指示。習(xí)總書(shū)記以高屋建瓴的戰(zhàn)略胸懷和俯瞰全球的國(guó)際視野，深刻闡述了青藏高原環(huán)境變化和研究及其在全球生態(tài)環(huán)境中的重要性，要求通過(guò)這次科學(xué)考察研究揭示青藏高原環(huán)境變化機(jī)理、優(yōu)化生態(tài)安全屏障體系，殷切期望廣大科考人員發(fā)揚(yáng)老一輩科學(xué)家艱苦奮斗、團(tuán)結(jié)奮進(jìn)、勇攀高峰的精神，為守護(hù)好世界上最后一方凈土、建設(shè)美麗的青藏高原作出新貢獻(xiàn)，這充分體現(xiàn)了以習(xí)近平同志為核心的黨中央的生態(tài)文明建設(shè)理念和綠色發(fā)展思想，為此次科考指明了前進(jìn)方向，提供了基本遵循。中共中央政治局委員、國(guó)務(wù)院副總理劉延?xùn)|在啟動(dòng)儀式上宣讀了習(xí)近平總書(shū)記的賀信，并要求第二次青藏高原綜合科學(xué)考察研究要服務(wù)國(guó)家生態(tài)文明建設(shè)、加強(qiáng)統(tǒng)籌協(xié)調(diào)、加強(qiáng)協(xié)同創(chuàng)新、注重綜合交叉研究和堅(jiān)持國(guó)際科技合作，努力取得重大科研突破，為青藏高原經(jīng)濟(jì)社會(huì)發(fā)展和生態(tài)環(huán)境保護(hù)作出新貢獻(xiàn)。